Phylogénie moléculaire - cycle 2 Mixte : présentiel / à distance
Dernière mise à jour : 06/03/2024
Description
- Rappels sur les principaux tests statistiques, la comparaison de modèles, le principe du bootstrap
- Phylogénomique : analyse de jeux de données multi-gènes
- Détection de la sélection darwinienne au sein de séquences codantes
- Analyse de données de méta-génomique, placement phylogénétique
- Phylodynamique : combiner épidémiologie et évolution
- Datation moléculaire : intégrer fossiles et molécules
- Combiner données génétiques et géographiques : phylogéographie bayésienne
- Visualisation de l'information en phylogénie
Programme détaillé téléchargeable ICI
Ce programme pourra être ajusté en fonction du profil des participants.
Objectifs de la formation
Être capable de tester des hypothèses et d'ajuster des modèles permettant de comprendre l'évolution à l'échelle moléculaire
Public visé
Chercheurs et ingénieurs
Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable ICI devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription.
Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable ICI devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription.
Prérequis
- Familiarité avec les principales lignes de commande dans des environnements de travail de type Linux
- Maîtriser les notions de base en statistiques et probabilités
- La maîtrise d'un langage de programmation est préférable
- Avoir des notions de phylogénie moléculaire
Avoir suivi le stage "Phylogénie moléculaire - Cycle 1" ou niveau équivalent
Modalités pédagogiques
- Alternance de cours (9 h) et de TD / TP (9 h)
- TP encadrés par 2 intervenants
Tout au long de la formation, des exercices corrigés permettront au stagiaire d'évaluer son acquisition des connaissances.
Un fichier au format PDF sera mis à disposition du stagiaire.
Moyens et supports pédagogiques
Un ordinateur sera mis à disposition de chaque stagiaire.
Profil du / des Formateur(s)
B. Linard, S. Guindon, G. Danesh, D. Fargette (chercheurs), E. Douzery (professeur) et V. Lefort (ingénieur)